Mit "Prefix :" (das ist standardmäßig Ctrl+B :) gelangt man in die Tmux-Kommandozeile. Will man zum Beispiel Window 3 mit Window 1 tauschen, gib man ein:

swap-window -s 3 -t 1

Um das aktuelle Fenster mit dem obersten Fenster zu tauschen, gibt man ein

swap-window -t 0

In dem unwahrscheinlichen Fall, dass kein Fenster bei Index 0 vorhanden ist, gibt man ein

move-window 0

Das Kommando

move-window <NUMBER>

erreicht man über die Eingabe von

Ctrl+B, 

.